apelisin, ставлю на все сервера lftp и с помощью него делаю ежесуточное зеркалирование содержимого нужных папок, предварительно сливая в одну из папок базы данных на сервере.
Вопрос по теме задавал тут и тут же разобрался не без помощи:
http://www.bormotuhi.net/showthread.php?t=15569