Не совсем вопрос понятен.
Ты войти не можешь через FTP или что?
Ответы на твой вопрос таковы:
Если хочешь организовать FTP, то скорее всего там не установлен FTP-сервер - решение такое: установить на VDS FTP-сервер. Как установить узнаешь по-гуглив для своей системы (Debian, Ubuntu и т.п.)
Если хочешь войти по FTP на VDS, то установи на своем компе
WINSCP
Далее запускаешь, указываешь IP своего VDS логин и пароль и все.