Чтобы при переустановке системы не было мучительно больно за потерянные закачки, нужно предварительно сделать всего одну несложную ситуацию, а именно - сохранить настройки клиента:
В XP они хранятся здесь:
C:\Documents and Settings\[USER]\Application Data\uTorrent
В Vista хранятся здесь:
C:\Users\<Имя пользователя>\appdata\roaming\uTorrent
Ну и не забудьте переместить папки со скаченным и частично скаченным добром, если потребуется.
После переустановки системы верните папки в исходное положение и скопируйте настройки обратно в профиль пользователя, после чего запустите uTorrent.
Скопипастил.
Вот еще интересный пост до кучи