Воспользуйся скриптом dumper
http://sypex.net/ru/products/dumper/downloads/ качай Sypex Dumper Lite 1.0.8
1. Откроешь файл dumper.php введёшь данные своей бд (адрес сервера и имя базы)
2. Закинешь на сервак файл dumper.php
3. Создай на сервере каталог backup ,установи на него права 777
4. Закинь туда свою базу
5. Потом входишь
http://адрес.сайта/dumper.php
6. Вводишь логин и пароль к бд и ставишь галочку напротив Restor/ Восстановление БД... ,и выбираешь базу и сам файл который должен находиться в каталоге backup
и всё.
У меня у самого база 250 мб