sertaras, на все твои вопрос ответ один: HTML + CSS. Каждый шаблон построен по своему и может отличаться в своем построении и содержимом. Все зависит от автора шаблона. Поэтому править шабы без знания HTML + CSS практически бессмысленно.
Основные понятия и обзор структуры шаблона можно посмотреть тут:
Верстаем шаблон для DLE [Видеокурс]