ghost, ну начнем с того, что ты подразумеваешь под видео в формате флеш? Это swf или flv или может еще хуже - f4v? В каком у тебя формате видео? Если flv - то никаких проблем не возникает при просмотре (проверено убунту 9.04 и 9.10) f4v тоже работает, а swf если честно - не пробовал.
Кнкретизируй, тогда мы точно поможем, с флешем то точно разберемся
