Она (точнее он) хорош тем, что все остальные базируются на именно на нем. К примеру, все существующие видеоконверторы которые конвертируют в формат MP4 используют ffmpeg + x264, но они об это молчат, мы мол сами, своими силами конвертим, но вот незадача, если использовать ffmpeg напрямую, то скорость кодирования возрастает иногда в разы

Это затавляет задуматься. FFmpeg и Mencoder (Входит в состав Mplayer"а) Лучшие программы для работы с захватом, изменением или обработкой видео, причем они созданы изначально для Линуксов, а потом были портированы на Вин платформу.
ЗЫ. На убунте что Менкодер что FFmpeg изначально обрезаны, придется ставить полный пак из репозитория (или как там его)
ЗЫ2. Вот команда для FFmpeg для захвата экрана (х11) направления вывода в файл out.mpg